医院设有卫生部临床药理研究基地和国家食品药品监督管理局药物临床试验机构(13个专业)、1个教育部重点实验室、1个国家中医药管理局中医药科研三级实验室、4个省部级重点实验室,6个省部级重点学科、24个卫生部专科/住院医师规范化培训基地,12个省质量控制和技术指导中心,7个浙江大学医学研究所,为浙江加州国际纳米技术研究院第一分院正式挂牌单位,同时拥有人体和动物PET的医学PET中心,承办中华系列杂志之一《中华急诊医学杂志》,以及英文版《World Journal of Emergency Medicine》。